[Donald]

Die IgM Antikörper waren dann letztendlich negativ, die IgG noch positiv, dann wurde davon ausgegangen dass die Borrelien bekämpft sind und nicht die Ursache für die Knieprobleme waren.

Hallo, das kann man keinesfalls aus deiner Serologie schließen. IgM gehen meist nach Wochen/Monaten von alleine zurück.
Anhand der Antikörper ist grundsätzlich keine Therapiekontrolle möglich.

Ansonsten kann ich Dir nur sagen, daß einseitig geschwollenes Knie ein besonders typisches Borreliosesymptom ist.
Andererseits wäre dann ein gutes Ansprechen auf Antibiotikum zu erwarten.
Zur Abklärung könnte man noch Gelenkpunktat untersuchen. Per PCR oder über einen Kulturversuch. Im positiven Falle wäre das quasi beweisend.
Gruß
Donald